Bone Collection mengikuti kisah seorang gadis muda bernama Ami yang hidup di dunia di mana manusia dan monster hidup berdampingan namun penuh ketegangan. Ketika keluarganya hilang secara misterius, Ami memulai perjalanan untuk mengungkap kebenaran di balik hilangnya mereka sambil menghadapi berbagai makhluk supernatural yang menghalangi jalannya. Dalam perjalanannya, ia menemukan kekuatan tersembunyi dalam dirinya sendiri yang membuatnya menjadi kunci untuk menjaga keseimbangan antara dunia manusia dan makhluk lain. Selama pencariannya, Ami bertemu dengan berbagai karakter unik yang membantunya melihat sisi lain dari konflik yang ada. Dia belajar bahwa tidak semua monster adalah musuh dan bahwa kebenaran sering kali tersembunyi di balik apa yang terlihat. Bone Collection menggabungkan elemen aksi, misteri, dan drama emosional yang mendalam untuk menggambarkan pertumbuhan Ami menjadi pribadi yang lebih kuat dan bijaksana.
