Magic Kaito mengikuti petualangan Kaito Kuroba, seorang siswa SMA yang secara tak sengaja mengetahui identitas sebenarnya dari ayahnya sebagai pesulap legendaris dan pencuri misterius yang dikenal dengan nama Kaito Kid. Setelah kematian ayahnya yang misterius, Kaito memutuskan untuk mengambil alih peran tersebut dan menggunakan kecerdikan serta keahliannya dalam sulap untuk mengungkap rahasia di balik kematian sang ayah sambil menghadapi berbagai tantangan dan musuh yang berusaha menggagalkannya. Dalam setiap aksinya, Kaito harus mengelabui polisi dan penjahat dengan trik-trik sulap yang memukau dan rencana yang matang. Cerita ini memadukan ketegangan, aksi, dan humor, menggambarkan bagaimana Kaito bertumbuh dan belajar tentang arti keadilan serta tanggung jawab seiring dia menyelinap dalam dunia misterius Kaito Kid.
