Tsumi to Batsu no Spica mengisahkan kehidupan seorang remaja bernama Spica yang menghadapi pergulatan batin menyusul keputusan penting yang mengubah jalan hidupnya. Ia dihadapkan pada dilema antara mempertahankan nilai moral atau mengikuti keinginan pribadi yang bisa membahayakan dirinya. Sepanjang cerita, Spica berusaha memahami konsekuensi pilihan tersebut sambil mencari jati diri dan keadilan bagi dirinya sendiri. Dalam perjalanannya, Spica bertemu dengan berbagai karakter yang mempengaruhi pandangannya terhadap dunia dan diri sendiri. Melalui konflik dan peristiwa dramatis yang terjadi, cerita ini menggambarkan bagaimana perjuangan internal dan eksternal dapat membentuk karakter dan keputusan seseorang, menunjukkan kompleksitas manusia dalam menghadapi dosa dan hukuman yang mungkin datang.
